🧠 Workflow Clínico Aumentado

Asistentes de IA &
Agentes Clínico/Investigador

Cómo uso la inteligencia artificial (Hermes) para automatizar el workflow de lectura científica, toma de apuntes y construcción de una base de conocimiento viva con Obsidian + LLM Wiki.

🤖 ¿Qué es un LLM?

Un modelo de lenguaje (LLM) es un motor de predicción de texto entrenado con millones de documentos.

🧮
No es una base de conocimiento.
Es una calculadora de palabras: predice la siguiente palabra más probable según el contexto.

Saber hacer

Resumir, traducir, extraer, clasificar, estructurar, comparar

NO sabe

Tu especialidad, los últimos estudios, las guías locales, los datos de tus pacientes

⚙️ Cómo funciona (lo justo para entenderlo)

Cuando un LLM responde, convierte tus palabras en números, mide relaciones y hace billones de cálculos en milisegundos. Así funciona por dentro:

🔢
Embeddings
Cada palabra se convierte en coordenadas numéricas. Las palabras parecidas quedan cerca, las distintas lejos. Como un GPS del significado.
👁️
Atención (Transformer)
Cada palabra «mira» a todas las demás para decidir qué información es relevante. Así «gato» se relaciona con «negro» pero no con «el».
🧮
Red Neuronal
Capas de neuronas artificiales que hacen billones de multiplicaciones y sumas por respuesta. De ahí emerge la capacidad de producir texto coherente.

📐 Todo es matemáticas

La diferencia entre un LLM y una regresión lineal es de escala, no de naturaleza. Ambos hacen cálculos — uno con números, el otro con palabras convertidas en números.

📏 Regresión Lineal
Entrada
x = [0.5, 2.1, 7.3]
Caja negra
y = mx + b
2 parámetros
Resultado
y = 3.8
Multiplica cada x por su peso Suma todo Añade el sesgo (bias)
🧠 LLM — Mismo principio
Entrada
"¿Qué es la diabetes?"
Caja negra
y = f(W·x + b)
miles de millones de parámetros
Resultado
"La diabetes es una enfermedad..."
Tokeniza → convierte texto a números Capas de atención: cada token «mira» a los demás Predice el siguiente token más probable
🧮 El LLM no piensa, no entiende, no es consciente. Solo hace cálculos — muchísimos más que una regresión lineal, pero el principio es el mismo: entran datos, salen predicciones.

⚠️ El peligro… y la solución

El LLM no es un oráculo. Si le preguntas directamente, inventa con apariencia convincente. La clave es usarlo como procesador de documentos, no como memoria.

❌ Uso ingenuo
"Dime los criterios diagnósticos de diabetes MODY"
→ El LLM responde con lo que «cree» que es cierto. Mezcla guías, inventa referencias, generaliza incorrectamente.
✅ Uso correcto
"Aquí tienes el PDF de la guía. Extráeme los criterios."
→ El LLM procesa el documento real. Resultado verificable. Tú mantienes el control.
📄
Fuente real PDF, PubMed, web
HARNESS Hermes
🤖
LLM Procesa, no inventa
📝
Conocimiento Verificable + trazable

🧠 Contexto vs Memoria

Dos conceptos que se confunden. El contexto es lo que el LLM «ve» ahora. La memoria es lo que recuerda entre conversaciones. No son lo mismo.

🔍 Contexto (ventana)

El LLM procesa todo el texto que cabe en su ventana. Como una mesa de trabajo: pones documentos encima, al cerrar la conversación la mesa se vacía.

Ventanas actuales (modelo → tokens):
Anthropic Claude Opus 4.81 000 000
OpenAI GPT-5.5922 000
Google Gemini 3.1 Pro1 000 000
Meta Llama 4 Scout10 000 000
1 token ≈ 0.75 palabras · 1M tokens ≈ ~750 páginas
💾 Memoria (persistente)

Los LLM no tienen memoria nativa. Cada conversación empieza en blanco. Para que «recuerden» necesitamos mecanismos externos:

1 Ventana de contexto — meter todo el histórico. Escala mal.
2 RAG — buscar fragmentos e inyectarlos en el contexto. Bueno para hechos concretos.
3 Memoria persistente — el LLM escribe y lee de una base externa (wiki, archivos). El conocimiento se acumula.
📌 Contexto = corto plazo · Memoria = largo plazo

👨‍🔬 Andrej Karpathy

Rol AI Researcher & Educator
Ex Director of AI @ Tesla
Ex Founding Member @ OpenAI
Hoy Divulga y construye herramientas educativas

Karpathy es conocido por su capacidad de explicar conceptos complejos de IA de forma clara. Su idea de la LLM Wiki es el corazón de este sistema.

RAG clásico

Subes documentos → el LLM busca fragmentos en cada consulta → redescubres el conocimiento desde cero cada vez. Nada se acumula.

VS

LLM Wiki

El LLM construye una wiki persistente → el conocimiento se compila una vez y se mantiene actualizado. Las conexiones ya están hechas.

🏛️ Arquitectura LLM Wiki: 3 Capas

El framework de Karpathy organiza el conocimiento en tres capas que evolucionan juntas.

1 Raw / Fuentes 🔒 Tú curadas

Inmutables. El LLM lee pero nunca modifica. Fuente de verdad.

📄 Papers 🌐 Artículos 📑 Transcripts
2 La Wiki 🧠 El LLM escribe

Archivos markdown interconectados. El LLM crea, actualiza y entrecruza.

entities/ dapagliflozina.md dm1.md sglt2.md
concepts/ mecanismo-accion.md guia-ada-2025.md
comparisons/ isglt2-vs-glp1.md
3 Schema + Índice 📋 Co-evolucionáis

Define convenciones, taxonomía y el catálogo. El sistema de gobierno.

SCHEMA.md — Reglas del sistema index.md — Catálogo de páginas log.md — Registro cronológico

🔄 Las 3 operaciones

Con estas tres operaciones, la wiki se mantiene viva y actualizada sin esfuerzo manual.

📥 Ingest
1. Lees un paper
2. Lo añades a raw/
3. El LLM lee, resume y extrae
4. Actualiza 10-15 páginas de la wiki
Puedes ingestar de 1 en 1 o en lote
🔍 Query
1. Lees index.md para orientarte
2. El LLM busca páginas relevantes
3. Sintetiza respuesta con citas
4. Las respuestas valiosas se guardan
El conocimiento se acumula, no se pierde
🧹 Lint
1. El LLM revisa la salud de la wiki
2. Detecta contradicciones
3. Encuentra páginas huérfanas
4. Sugiere nuevas fuentes
Mantiene la wiki sana a medida que crece

🟢 Open WebUI — el primer paso

Antes de un agente completo, empieza con una interfaz self-hosted donde tus datos nunca salen de tu infraestructura.

🔒

Tus datos, tu control

Open WebUI corre en tu servidor. Los PDFs, documentos y consultas nunca tocan servidores externos sin tu permiso.

📄

Carga y pregunta

Subes un PDF de 200 páginas y le haces preguntas. El LLM lo procesa con RAG integrado — sin configuración.

🧩

Eliges el modelo

Claude, GPT, DeepSeek, modelos abiertos locales… Cambias de modelo sin mover tus conversaciones.

👨‍⚕️

Sin saber programar

Interfaz web, funciona en móvil, sin terminal, sin comandos. Solo navegador.

✅ Open WebUI es el entry point. Cuando necesites automatización, crons, skills y una wiki viva →

⚡ Hermes & los LLMs

El agente que lo orquesta todo — el cambio frente a las herramientas separadas

❌ Antes
🔍Buscabas papers manualmente en PubMed
📝Leías y tomabas notas a mano
📂PDFs perdidos, bookmarks olvidados
💬ChatGPT para preguntas sueltas — sin memoria
🧠Conocimiento fragmentado, sin conexiones
🟡 Intermedio
📤Subes el paper a ChatGPT / Claude
📋Te lo resume — pero tú tienes que pedírselo
✂️Copias, pegas y ordenas manualmente
Proceso manual + lento — se acumulan
🔄Cada vez empiezas de cero — no hay acumulación
✅ Ahora (Hermes)
🤖Hermes — agente 24/7 que captura, procesa y estructura
🧩Usa el LLM que quieras: Claude · GPT · Gemini · DeepSeek
🔄Cron jobs automáticos: busca, lee, resume, archiva
📚Wiki viva que se alimenta sola — el conocimiento se acumula
🔗Conexiones entre conceptos que tú no habrías visto
Tú escoges el LLM. Hermes lo orquesta.

🔄 El flujo completo

De la fuente al conocimiento acumulado, con un agente que orquesta cada paso.

📡 Captura
PubMed / arXiv Blogs / RSS Zotero + WebDAV
⚡ Hermes
Skills Cron jobs Orquesta
🤖 LLM
Extrae Resume Enlaza
📝 Wiki
raw/ entities/ concepts/
👨‍⚕️ Tú
Supervisas + decides

🎯 Por qué esto importa

El valor real para el clínico-investigador

De horas a minutos

Lo que antes llevaba una tarde de lectura ahora se hace mientras atiendes pacientes. El agente procesa mientras tú trabajas.

🧩

Conocimiento que se acumula

Cada artículo leído no se olvida. Se enlaza con lo anterior. Como un segundo cerebro que recuerda todo.

🔗

Conexiones inesperadas

El grafo revela relaciones ocultas. Un fármaco de cardiología que aparece en un paper sobre DM1.

🔄

Open source mindset

Astro, Obsidian, Karpathy's LLM Wiki — herramientas abiertas. Tu conocimiento no queda atrapado en silos.

📱 Demo en vivo

📨 Telegram
Busca lo último sobre bombas de insulina con IA
🔍 Buscando en PubMed...
📄 Encontrados 3 artículos relevantes
🧠 Ingiendo en wiki...
✅ Listo. Resumen disponible.
📊 Resultado
Closed-loop control with AI
Nimri et al., Diabetes Care 2025
Machine learning for insulin dosing
Boughton et al., Lancet 2024
💡 Conexión detectada: ambos citan el mismo estudio de cohorte
🚀

¿Te gustaría tener esto?

Este sistema se puede replicar y adaptar a cualquier especialidad.
Hablemos.

👨‍⚕️ Javier Peñate — Endocrinólogo
🔗 charla.javierpenate.com