🧠 Workflow Clínico Aumentado

Asistentes de IA &
Agentes Clínico/Investigador

Cómo uso la inteligencia artificial (Hermes) para automatizar el workflow de lectura científica, toma de apuntes y construcción de una base de conocimiento viva con Obsidian + LLM Wiki.

🤖 ¿Qué es un LLM?

Un modelo de lenguaje (LLM) es un motor de predicción de texto entrenado con millones de documentos.

🧮
No es una base de conocimiento.
Es una calculadora de palabras: predice la siguiente palabra más probable según el contexto.
✅

Saber hacer

Resumir, traducir, extraer, clasificar, estructurar, comparar

❌

NO sabe

Tu especialidad, los últimos estudios, las guías locales, los datos de tus pacientes

⚙️ Cómo funciona (lo justo para entenderlo)

Cuando un LLM responde, convierte tus palabras en números, mide relaciones y hace billones de cálculos en milisegundos. Así funciona por dentro:

🔢
Embeddings
Cada palabra se convierte en coordenadas numéricas. Las palabras parecidas quedan cerca, las distintas lejos. Como un GPS del significado.
👁️
Atención (Transformer)
Cada palabra «mira» a todas las demás para decidir qué información es relevante. Así «gato» se relaciona con «negro» pero no con «el».
🧮
Red Neuronal
Capas de neuronas artificiales que hacen billones de multiplicaciones y sumas por respuesta. De ahí emerge la capacidad de producir texto coherente.

📐 Todo es matemáticas

La diferencia entre un LLM y una regresión lineal es de escala, no de naturaleza. Ambos hacen cálculos — uno con números, el otro con palabras convertidas en números.

📏 Regresión Lineal
Entrada
x = [0.5, 2.1, 7.3]
→
Caja negra
y = mx + b
2 parámetros
→
Resultado
y = 3.8
• Multiplica cada x por su peso • Suma todo • Añade el sesgo (bias)
🧠 LLM — Mismo principio
Entrada
"¿Qué es la diabetes?"
→
Caja negra
y = f(W·x + b)
miles de millones de parámetros
→
Resultado
"La diabetes es una enfermedad..."
• Tokeniza → convierte texto a números • Capas de atención: cada token «mira» a los demás • Predice el siguiente token más probable
🧮 El LLM no piensa, no entiende, no es consciente. Solo hace cálculos — muchísimos más que una regresión lineal, pero el principio es el mismo: entran datos, salen predicciones.

⚠️ El peligro… y la solución

El LLM no es un oráculo. Si le preguntas directamente, inventa con apariencia convincente. La clave es usarlo como procesador de documentos, no como memoria.

❌ Uso ingenuo
"Dime los criterios diagnósticos de diabetes MODY"
→ El LLM responde con lo que «cree» que es cierto. Mezcla guías, inventa referencias, generaliza incorrectamente.
→
✅ Uso correcto
"Aquí tienes el PDF de la guía. Extráeme los criterios."
→ El LLM procesa el documento real. Resultado verificable. Tú mantienes el control.
📄
Fuente real PDF, PubMed, web
→
⚡
HARNESS Hermes
→
🤖
LLM Procesa, no inventa
→
📝
Conocimiento Verificable + trazable

🧠 Contexto vs Memoria

Dos conceptos que se confunden. El contexto es lo que el LLM «ve» ahora. La memoria es lo que recuerda entre conversaciones. No son lo mismo.

🔍 Contexto (ventana)

El LLM procesa todo el texto que cabe en su ventana. Como una mesa de trabajo: pones documentos encima, al cerrar la conversación la mesa se vacía.

Ventanas actuales (modelo → tokens):
Anthropic Claude Opus 4.81 000 000
OpenAI GPT-5.5922 000
Google Gemini 3.1 Pro1 000 000
Meta Llama 4 Scout10 000 000
1 token ≈ 0.75 palabras · 1M tokens ≈ ~750 páginas
💾 Memoria (persistente)

Los LLM no tienen memoria nativa. Cada conversación empieza en blanco. Para que «recuerden» necesitamos mecanismos externos:

1 Ventana de contexto — meter todo el histórico. Escala mal.
2 RAG — buscar fragmentos e inyectarlos en el contexto. Bueno para hechos concretos.
3 Memoria persistente — el LLM escribe y lee de una base externa (wiki, archivos). El conocimiento se acumula.
📌 Contexto = corto plazo · Memoria = largo plazo

👨‍🔬 Andrej Karpathy

Rol AI Researcher & Educator
Ex Director of AI @ Tesla
Ex Founding Member @ OpenAI
Hoy Divulga y construye herramientas educativas

Karpathy es conocido por su capacidad de explicar conceptos complejos de IA de forma clara. Su idea de la LLM Wiki es el corazón de este sistema.

❌

RAG clásico

Subes documentos → el LLM busca fragmentos en cada consulta → redescubres el conocimiento desde cero cada vez. Nada se acumula.

VS
✅

LLM Wiki

El LLM construye una wiki persistente → el conocimiento se compila una vez y se mantiene actualizado. Las conexiones ya están hechas.

🏛️ Arquitectura LLM Wiki: 3 Capas

El framework de Karpathy organiza el conocimiento en tres capas que evolucionan juntas.

1 Raw / Fuentes 🔒 Tú curadas

Inmutables. El LLM lee pero nunca modifica. Fuente de verdad.

📄 Papers 🌐 Artículos 📑 Transcripts
2 La Wiki 🧠 El LLM escribe

Archivos markdown interconectados. El LLM crea, actualiza y entrecruza.

entities/ dapagliflozina.md dm1.md sglt2.md
concepts/ mecanismo-accion.md guia-ada-2025.md
comparisons/ isglt2-vs-glp1.md
3 Schema + Índice 📋 Co-evolucionáis

Define convenciones, taxonomía y el catálogo. El sistema de gobierno.

SCHEMA.md — Reglas del sistema index.md — Catálogo de páginas log.md — Registro cronológico

🔄 Las 3 operaciones

Con estas tres operaciones, la wiki se mantiene viva y actualizada sin esfuerzo manual.

📥 Ingest
1. Lees un paper
2. Lo añades a raw/
3. El LLM lee, resume y extrae
4. Actualiza 10-15 páginas de la wiki
Puedes ingestar de 1 en 1 o en lote
🔍 Query
1. Lees index.md para orientarte
2. El LLM busca páginas relevantes
3. Sintetiza respuesta con citas
4. Las respuestas valiosas se guardan
El conocimiento se acumula, no se pierde
🧹 Lint
1. El LLM revisa la salud de la wiki
2. Detecta contradicciones
3. Encuentra páginas huérfanas
4. Sugiere nuevas fuentes
Mantiene la wiki sana a medida que crece

🟢 Open WebUI — el primer paso

Antes de un agente completo, empieza con una interfaz self-hosted donde tus datos nunca salen de tu infraestructura.

🔒

Tus datos, tu control

Open WebUI corre en tu servidor. Los PDFs, documentos y consultas nunca tocan servidores externos sin tu permiso.

📄

Carga y pregunta

Subes un PDF de 200 páginas y le haces preguntas. El LLM lo procesa con RAG integrado — sin configuración.

🧩

Eliges el modelo

Claude, GPT, DeepSeek, modelos abiertos locales… Cambias de modelo sin mover tus conversaciones.

👨‍⚕️

Sin saber programar

Interfaz web, funciona en móvil, sin terminal, sin comandos. Solo navegador.

✅ Open WebUI es el entry point. Cuando necesites automatización, crons, skills y una wiki viva → ⬇

⚡ Hermes & los LLMs

El agente que lo orquesta todo — el cambio frente a las herramientas separadas

❌ Antes
🔍Buscabas papers manualmente en PubMed
📝Leías y tomabas notas a mano
📂PDFs perdidos, bookmarks olvidados
💬ChatGPT para preguntas sueltas — sin memoria
🧠Conocimiento fragmentado, sin conexiones
🟡 Intermedio
📤Subes el paper a ChatGPT / Claude
📋Te lo resume — pero tú tienes que pedírselo
✂️Copias, pegas y ordenas manualmente
⏰Proceso manual + lento — se acumulan
🔄Cada vez empiezas de cero — no hay acumulación
✅ Ahora (Hermes)
🤖Hermes — agente 24/7 que captura, procesa y estructura
🧩Usa el LLM que quieras: Claude · GPT · Gemini · DeepSeek
🔄Cron jobs automáticos: busca, lee, resume, archiva
📚Wiki viva que se alimenta sola — el conocimiento se acumula
🔗Conexiones entre conceptos que tú no habrías visto
Tú escoges el LLM. Hermes lo orquesta.

🔄 El flujo completo

De la fuente al conocimiento acumulado, con un agente que orquesta cada paso.

📡 Captura
PubMed / arXiv Blogs / RSS Zotero + WebDAV
→
⚡ Hermes
Skills Cron jobs Orquesta
→
🤖 LLM
Extrae Resume Enlaza
→
📝 Wiki
raw/ entities/ concepts/
→
👨‍⚕️ Tú
Supervisas + decides

🎯 Por qué esto importa

El valor real para el clínico-investigador

⚡

De horas a minutos

Lo que antes llevaba una tarde de lectura ahora se hace mientras atiendes pacientes. El agente procesa mientras tú trabajas.

🧩

Conocimiento que se acumula

Cada artículo leído no se olvida. Se enlaza con lo anterior. Como un segundo cerebro que recuerda todo.

🔗

Conexiones inesperadas

El grafo revela relaciones ocultas. Un fármaco de cardiología que aparece en un paper sobre DM1.

🔄

Open source mindset

Astro, Obsidian, Karpathy's LLM Wiki — herramientas abiertas. Tu conocimiento no queda atrapado en silos.

📱 Demo en vivo

📨 Telegram
Busca lo último sobre bombas de insulina con IA
🔍 Buscando en PubMed...
📄 Encontrados 3 artículos relevantes
🧠 Ingiendo en wiki...
✅ Listo. Resumen disponible.
📊 Resultado
Closed-loop control with AI
Nimri et al., Diabetes Care 2025
Machine learning for insulin dosing
Boughton et al., Lancet 2024
💡 Conexión detectada: ambos citan el mismo estudio de cohorte
🚀

¿Te gustaría tener esto?

Este sistema se puede replicar y adaptar a cualquier especialidad.
Hablemos.

👨‍⚕️ Javier Peñate — Endocrinólogo
🔗 charla.javierpenate.com